Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap42B2RQE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap42B2RQE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms