Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930402K13RikB1AW18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930402K13RikB1AW18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930402K13RikB1AW18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930402K13RikB1AW18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms