Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2B1AVH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2B1AVH7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2B1AVH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms