Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Proca1B0QZF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Proca1B0QZF7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Proca1B0QZF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Proca1B0QZF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms