Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttll11A4Q9F4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll11A4Q9F4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms