Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr16A3KMN5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr16A3KMN5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr16A3KMN5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr16A3KMN5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr16A3KMN5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr16A3KMN5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr16A3KMN5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr16A3KMN5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr16A3KMN5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prr16A3KMN5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms