Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b5A3FIN4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b5A3FIN4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b5A3FIN4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b5A3FIN4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b5A3FIN4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b5A3FIN4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b5A3FIN4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b5A3FIN4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b5A3FIN4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms