Protein–RNA interactions for Protein: A2BDP1

Fam155b, Transmembrane protein FAM155B, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam155bA2BDP1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam155bA2BDP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam155bA2BDP1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam155bA2BDP1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam155bA2BDP1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms