Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cavin4A2AMM0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Cavin4A2AMM0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cavin4A2AMM0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms