Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4985A2ALC6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4985A2ALC6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4985A2ALC6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm4985A2ALC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm4985A2ALC6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4985A2ALC6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.3 ms