Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm11A2AGX3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm11A2AGX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Prdm11A2AGX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm11A2AGX3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms