Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34dA2AGU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn34dA2AGU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms