Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmpd4A2AFR3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmpd4A2AFR3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms