Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramef6A2A8M8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms