Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprfA2A8L5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprfA2A8L5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprfA2A8L5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms