Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hivep3A2A884 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hivep3A2A884 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms