Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calcoco2A2A6M5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calcoco2A2A6M5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calcoco2A2A6M5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Calcoco2A2A6M5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms