Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm6268A2A3U9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm6268A2A3U9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gm6268A2A3U9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms