Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup205A0A0J9YUD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup205A0A0J9YUD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup205A0A0J9YUD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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