Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg4a-psA0A0G2JFS9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms