Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms