Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms