Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Robo3Q9Z2I4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms