Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms