Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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