Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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