Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PapolbQ9WVP6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms