Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NumbQ9QZS3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NumbQ9QZS3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms