Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms