Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms