Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SacsQ9JLC8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms