Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms