Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tspan4Q9DCK3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tspan4Q9DCK3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tspan4Q9DCK3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tspan4Q9DCK3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tspan4Q9DCK3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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Tspan4Q9DCK3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms