Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms