Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Capns2Q9D7J7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Capns2Q9D7J7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Capns2Q9D7J7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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