Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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