Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms