Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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