Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms