Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PrameQ9D4Z5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrameQ9D4Z5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrameQ9D4Z5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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