Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eef1e1Q9D1M4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms