Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms