Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chchd1Q9CQA6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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