Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms