Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms