Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TirapQ99JY1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms