Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Derl1Q99J56 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms