Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms