Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms