Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms